מיוונית: atomos) ἄτομος) ← לטינית: atomus ← שפות אירופה. פרוש המילה היוונית הוא "בלתי ניתן לחיתוך", והיא מורכבת מהתחילית a) ἀ), "לא", ושם־העצם tōmos) τόμος), "חיתוך", שנגזר מהפועל temnein) τέμνειν), "לחתוך". מילה זו יוחדה בתורתם של הפילוסופים לוקיפיוס ודמוקריטוס לחלקיק החומר הבסיסי שלא ניתן לחלקו, וניתנה לו כשנתגלה בעת החדשה, והסברה היתה שהוא בלתי ניתן לחלוקה. מאוחר יותר נתגלה שלמעשה אפשר לפרק את האטום לחלקיקים קטנים יותר.