הדעות חלוקות לגבי מקור השם, יש אומרים שהוא בא מהמילה basilica, שהיא סוג של כנסיה,[1] משום שבימי הביניים היו מגדלים את הבזיליקום בחצרות הבסילקה. דעה אחרת אומרת שמקור השם הוא מהמילה היוונית βασιλέας שפירושה 'מלך', משום שהרופאים בתקופה זו רחשו לו כבוד בגלל יכולות המרפא שלו [2].