לפי אחת הדעות השם כנרת נגזר מכינור, שכן צורתו של האגם היא כצורת הכינור. אולם ככל הנראה דעה זאת אינה נכונה, שכן צורתו של הכינור הקדום אינה דומה לצורתו של הכינור בן ימינו, ונראה שהסבר זה נוצר כתוצאה משיבוש של דברי התלמוד: "ולמה נקרא שמה כינרת דמתיקי פירא כקלא דכינרי" (תלמוד בבלי, מגילה ו ע"א) [ולמה נקרא שמה כנרת? כי מתוקים פרותיה כקול כינורות.] שמה של הכנרת במשנה, בתלמוד ובתוספתא הוא ימה של טבריא, שכן העיר טבריה ממוקמת בסמוך לכנרת. במקורות הללו מופיע לעתים השם גינוסר כשמה של הכנרת, על שם בקעת גינוסר הסמוכה אליה. שם זה התקבל גם בשפות אירופיות אחדות.