נראה שמדובר בנגזרת מן יוונית עתיקה - "יֶּנוֹס" γένος שפירושיה - אומה, שבט, גזע, משפחה. בלשון ארמית-ישראלית בהוראה דומה (וללא מרכיב הגזע)- גניסא, גנסא. עפ"י ירושלמי γενέσια "גנסיא" בהוראת "חג לציון יום הולדת המלך". (במקורו, נחוג החג לציון הולדת הקיסר אוגוסטוס).
בתקופת האמוראים קנתה לה אחיזה הסברה שכבר בימי קדם הומר שם האגם לשם יווני, בספרות האמוראית ניתן להבחין בזיקה הנקשרת בין תיבת "כ-נ-ר-ת", שבעיבוד ארמי-יווני כונתה "ג-נ-ס-ר-ת".
"ולמה הוא קורא אותה גיניסר? רבנן אמרי גני שרים", ר"ל -עפ"י אטימולוגיה עממית זו גינוסר אינה "כנרת" המקראית, אלא שהייתה נחלה מלכותית או שלטונית עתיקה כבר מימי השלטון היווני או החשמונאי. נראה שבתלמוד-ירושלמי לא קיימת תמימות דעים בקשר לזהוי היישוב גינוסר עם הכנרת המקראית המוזכרת בספר דברים. ויתכן שבירושלמי נרמז לכך שהעיר נחלקה לשתי "גינוסרות" (כנראה, שלאחת מהן רכב אלישע בן אבויה עם סוסו בדרכו לעבר השקיעה...) לעומת זאת בבבלי (המרבה לשבח את פירות גינוסר המתוקים) זיהוי כנרת עם גניסר, התקבל ללא שום ערעור.
רמב"ם מזהה את גינוסר עם ימת כנרת - "מקום בארץ הצבי יש בו גנות רבות, מדובר בו נכבדות ונפלאות, ועושין בו אוהלים לדירה כל זמן אסיפת הפירות, וזה המקום הוא שקראו התורה ”כִּנֶּ֖רֶת“ (במדבר לד, פסוק יא).
בתרגומים השונים ל-"כנרת" בתנ"ך (השם "כנרת" או "ים כנרת"/ "כנרות" מופיע שבע פעמים בתנ"ך) מופיע השם "גניסר" ונראה שהכינוי הזה לאגם המשיך להתקיים במקביל לכינוי "ימה של טבריה". בתרגום יונתן הארמי "מַדנַח יַם גִּנֵיסַר" היא ”קִדְמַ֣ת הַיָּ֔ם“ (יחזקאל לט, פסוק יא) .
ערך בוויקיפדיה: בקעת גינוסר
תמונות ומדיה בוויקישיתוף: גנוסר