אבגר צהוב גדל באירופה בבתי-גידול טחובים שאינם קשורים דווקא למקווי מים – שקעים או תת-יער פתוח. לעומת זאת גדל האבגר באזור הלבנט – ישראל, סוריה, לבנון וקפריסין – רק ליד מקווי מים.
לאבגר תכונות של כיווץ רקמות ובשילוב טעמו המר הופכים אותו לצמח מרפא יעיל למצבי עיכול בעייתיים בעיקר שלשול.